有效产出会计（Throughput Accounting，TA）是TOC在财务与会计的应用方式，原本是为制造环境而创，现在已被广泛使用于各种不同的行业。为了达到做决策的目的，相较于传统的成本会计（Cost Accounting，CA），TA提供一套包含系统限制资源的财务衡量方式。
两种方式，TA与CA，最大区别在于背后的系统假设。TOC相信管理者该尽可能改善投资报酬，及强调组织收益最大化。认为劳工及某些变动费用其实是较为固定的，将其视为系统的投资以利稳定运作。只要生产排程不会造成这些额外成本，即与生产排程的决定无关。
在”Reaching the Goal”书中以图一描述CA的元素。CA应用于1900初期时，主要的制造费用是劳工成本，工人费用是按件计酬。因而， 当时制作的财务报告，将直接劳工成本与其他经常费用（overhead expenses）分摊到产品成本。
图一：成本会计流程演示
然而，自从自动化成为制造主流，劳工按时计酬，劳工成本相较于其他经常费用是制造费用的小部分。将劳工成本分摊到产品成本时，以企业总体的财务角度来看没有问题，但是如产品价格按产品成本加上标准边际收益计算的话，劳工成本分摊会使价格失真（或扭曲实际情况）。即是，有些产品可能看似有利可图，事实上是亏本生意，反之亦同。
作业成本分析法（Activity-based Costing，ABC）是CA的一个变化方式，以利将分摊成本做的更好。例如，大量生产的产品需要较少次数的换线与检验，所以
较少的经常费用，但是ABC没考虑到顾客可能不买这个产品的情况。
| 『从发表的研究报告可见，大多数公司倾向使用成本数据来驱动效率性运作，而其实不该如此。在顾客驱动的全球经济情势下，达到具有竞争和获利的营运能力，公司必须给顾客他们想要的产品，而不是说服他们去买公司能低价生产的产品。』 |
关于CA的另一个问题是，鼓励工厂生产超额库存，超过当下实际所需的客户订购量。这是来自于追求高机器和人工使用率的压力，但往往造成过多库存。此外，以整体收益绩效来看，库存堆积与直觉背道而驰。库存不是以费用出现在损益表(Income Statement)上，库存成本是资产负债表(Balance Sheet)上的资产，结果是与实际收入无关，只是一时有助于收益报表上的业务表现。但是，假如库存一直未能售出，终究会转回来，在资产负债表上的库存变成损益表上的折旧费用（depreciation expense），结果视为库存损失。更进一步，超额库存不利于竞争因为成为生产的障碍，绑住本可有更好使用的资金（生产真正顾客要购买的产品）。
CA相关的第三个问题涉及管理优先级（management priority）。除了在执行长层次，大多数公司的主要绩效指标并不是利润。通常营运费用受到密切管理，因为众所周知且可直接控制。相反地，收入可控度较低，因为得依赖市场与顾客。库存是管理优先级的第三个指标，因为降低库存可能不利于报表的呈现。
然而，库存事实上对公司营运的竞争能力有重大的影响力。虽然收入并不是直接控制，但不像库存和营运费般受限于一定范围。就是说，为了维持活力的经营，降低库存与营运费用有一定限度。相反地，收入指标是无限度，在保持活力的经营之外，可不断增加。
在TOC的环境，按优化有效产出来决定优先级，接着是库存和营运费用。目标在于平衡组织的市场销售，产品开发，和费用控制。以达到卓越的营运表现，含稳定性，经济加值效益，和投资报酬。反之如因降低成本，而伤害到客户满意度，那终究会危及到组织收益。所以，顾客需求与取向该被视为决策过程的首要条件，而有效产出会计即是以此为目标的衡量机制。
TA采用一种不同的衡量方式来面对上面提到的问题，不使用产品成本，消除鼓励超额库存，和推翻典型的管理优先级。然而，TA不能取代一般的财务报告方式，因为上市公司必须符合一般公认会计原则（generally accepted accounting principles ，GAAP）。好在TA能与GAAP报告方式一致，虽然是一种不同的管理会计手段。
在”Reaching the Goal”书中以图二描述TA的元素。支持做决策在左边，具体结果在右边。图中有些熟悉的用词，但要注意计算方式通常与CA的算法不同。
图二：有效产出会计流程演示
TA始于三个财务指标：
有效产出（Throughput，T）：透过销售或利息产出金钱的速率，以收入减去总变动成本（Total Variable Cost，TVC）计算。
投资/库存（Investment/Inventory，I）：投资是为达销售东西的金钱，包含总变动成本，例如材料，用于生产的资源含土地，机器，卡车及计算机。有时一般用投资一词，生产环境用库存一词。
营运费用（Operating Expense，OE）：花在将投资转成有效产出的金钱，包含直接劳工，租金和间接薪资，加上公认的销售与行政成本。
透过销售产品或服务，以最大化T，价格与总变动成本间的最大差别，和最小化生产投资和销售收入间的时间。所以，T是由速度及大小来决定，因而设计TOC方案以最小化时间延迟。
注意到TA不用劳工成本来分摊OE，就是直接劳工不算为变动成本，因为公司不会按每次的需求数量变化去调整劳工。下列为财务指标用于计算绩效表现：
净利 = 有效产出－营运费用 （Net Profit: NP = T – OE）
投资报酬 = 净利/投资 （Return on Investment: ROI = NP / I）
生产力 = 有效产出/营运费用 （Productivity: P = T / OE）
库存周转数 = 有效产出/库存 （Inventory Turns: i= T / I）
理想的决策是提高T及降低I和OE。好的决策提高NP，ROI，生产力，或库存周转数。（注意到净利不是税及利息前的纯运作利润。）
TA还有限制指针：
一个限制单位的有效产出：T/CU ＝ （收入 – 总变动成本）/ 限制资源
（Throughput per Constraint Unit: T/CU = (revenue – totally variable cost) / units）限制资源使用率：限制资源实际用于生产的时间/限制资源可用于生产的时间
Constraint Utilization: U = time spent producing / time available to produce
最大化这些限制资源指标即是最大化T的方式。限制资源使用率是关键，因为流失限制资源每小时的产能即是流失整个工厂或公司的利益。但是如无追踪非限制资源的使用率，则会造成超额库存。依据T/CU的决定包含下列：
使用限制资源的优先级（例如，选择最好的产品组合）
决定是否以投资方式提高限制资源的产能
选择推出或退出市场的产品
根据使用限制资源的机会成本给产品定价
因此，做日常产品组合决策使用T/CU，决定最大化有效产出的产品组合。例如，某个产品少生产一个，而多生产些其他产品能提高T，即是一种好的决策。至于重要的决策可能使限制资源转移，会使某些产品流失T，采用下列的决策支持指标更好：
净利的变化（Change in Net Profit: △NP = △T –△OE）
这个△的数学符号代表差别，两个之间的比较。最大化△NP是确保全面改善产品以提升利润的重要决定。下列指标用于呈现投资决定的作用：
投资回收（Payback： PB = △NP /△I）
以控制指标来最小化脱离计划的情况，如下：
有效产出-元-天 = 延误订单的销售价格 x 延迟的天数（Throughput Dollar Days: TDD = Selling price of late order × days late）
库存-元-天 = 超额库存的销售价格 x 未售出的天数（Inventory Dollar Days: IDD = Selling price of excess inventory × days unsold）
TDD衡量应该完成却未完成的事情，准时发货。IDD衡量不应该做却做了的事，产出不必要的库存。这些控制指标的理想值是零。控制指标的数值越大，更是需要采取修正行动。当然，假如公司不是使用元 [注：一般指美元]，以价值一词取代，成为有效产出-价值-天（Throughput Value Days），和库存-价值-天（Inventory Value Days）。
总而言之，TA用于辨识限制资源，监督绩效，控制生产，和决定特殊决策的作用。下面图三呈现CA与TA对于产品组合决定的区别。现实操作中，可能需要为数不小的制造步骤来计算成千的产品，因而当系统限制转移而需重新计算是个问题。图三举了一个只有三个产品的例子，每个产品只有三个制造步骤，足以展示关键概念。例子中每个产品的制造步骤可能需要不同时间长度，但三个产品的总时间长度相同。还有，所有制造步骤每分钟的劳工成本相同。
每个产品A价格最高和原料成本最低。相反地，每个产品C价格最低和原料成本最高。由于相同工人可用于生产任何产品组合，最好的组合似乎是尽量生产产品A，然后是B，最后是C。依照这个优先级，工厂生产100个产品A，75个产品B及0个产品C。注意到步骤2局限公司的生产力，无论是否被视为是限制资源。
营运费用包含租金，能源和劳工。CA在原料成本的基础上，将营运费用分摊到产品，由最后得到的产品成本来决定优先级。产品A的产品成本比B低，A看来有利润，而B不是，似乎不生产B能停止亏损。因而，投到B的营运费用全由A来承担，这样一来亏损更大。再来，如果要保持步骤一到三的工人能完全使用，则在制品库存增加。因此，结果是没利润。
图三：CA与TA区别演示
有效产出提出一个完全不同的观点。TA根据每个限制资源单位的利润力，来排列产品的获利能力。TA不将营运费用分摊到产品成本。产品A的限制资单位是每分钟4元，B是4.17元，及C是4.44元。因此，TA判定尽可能生C，接着B，再是A的顺序。这与前面CA的顺序完全相反，因为步骤2是限制资源，只足够生产100个C，100个B，及20个A。以TA分析的结果是公司能获利。
有效使用TA需要跟CA不同的数据，所以报告格式必须更换。例如，TA报告呈现与系统限制资源有关的T，I及OE，而CA不在意限制资源。还有，CA与TA计算产品获利能力的方式不同，对订单的获利能力很不相同。
以下是几项TA值得注意之处：
财务指标揭露管理优先级，从OE-T-I，到T-I-OE。
绩效指标不被成本分摊曲解。
限制资源指标消除局部绩效（机器或工人的使用率）与整体绩效（公司财务绩效）的冲突。
控制指标排除鼓励超额库存的产生，及激励准时达交。